Группа биохимии адаптации микроорганизмов

Салина Елена Геннадьевна
Руководитель группы
доктор биологических наук
ИНБИ, корп. 2, комн. 207Telefone +7 (495) 954-40-34
E-Mail elenasalina@yandex.ru

Основное

ОПИСАНИЕ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ ГРУППЫ

Ключевые слова
Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium abscessus, микобактерии, латентный туберкулез, микобактериозы, факторы вирулентности, антибактериальные соединения, малые регуляторные РНК бактерий, транскриптомика.

Направления исследований

  • Функциональная роль малых регуляторных РНК бактерий
  • Факторы вирулентности и взаимодействие «патоген –хозяин» при инфекции
  • Транскриптомика микобактерий
  • Новые антибактериальных соединений и установление механизма их действия
  • Альтернативные подходы к терапии микобактериальных инфекций
  • Механизмы резистентности бактерий к антимикробным агентам

Основные методы исследований

  • Культивирование различных видов микобактерий, получение их метаболически инертных форм
  • Выделение и очистка нуклеиновых кислот
  • Транскриптомный анализ методом RNA-seq
  • Определение минимальной ингибирующей концентрации антибактериальных агентов in vitro
  • Определение внутриклеточной активности антибактериальных агентов в моделях инфекции ex vivo
  • Культивирование и инфекция макрофагов
  • Получение штаммов бактерий с делецией и гиперэкспрессией целевых генов
  • Количественная ПЦР в режиме реального времени

Краткая история группы
Группа образована в июне 2022 года в результате реорганизации лаборатории биохимии стрессов микроорганизмов.

 

Сотрудники

СОСТАВ ГРУППЫ

№ ФИО Ученая степень, звание Должность Место работы Городской телефон Внутренний телефон E-mail
1Салина
Елена Геннадьевна		д.б.н.руководитель группы, в.н.с.ИНБИ, корп. 2, комн. 207(495) 954-40-34138elenasalina@yandex.ru
2Ажикина
Татьяна Леодоровна		д.б.н.в.н.с.ИНБИ, корп. 12, ком. 207(495) 954-40-34138tatazhik@gmail.com
3Артюхина
Мария Викторовна		-м.н.с.ИНБИ, корп. 2, комн. 32(495) 954-40-34138masha.artyuhina@yandex.ru
4Григоров
Артем Сергеевич		-м.н.с.ИНБИ, корп. 2, ком. 207(495) 954-40-34138artgrigorov@gmail.com
5Дементьева
Ксения Алексеевна		-м.н.с.ИНБИ, корп. 2, комн. 32(495) 954-40-34138tukzar674@mail.ru
6Захарьева
Екатерина Витальевна		-ст. лаборантИНБИ, корп. 2, комн. 32(495) 954-40-34138kat-2003@mail.ru
7Мартини
Билли Александровна		к.б.н.м.н.с.ИНБИ, корп. 2, комн. 207(495) 954-40-34138abillymartiny@gmail.com

Публикации

ЗНАЧИМЫЕ ПУБЛИКАЦИИ
  1. Pogodin PV, Salina EG, Semenov VV, Raihstat MM, Druzhilovskiy DS, Filimonov DA, Poroikov VV. Ligand-based virtual screening and biological evaluation of inhibitors of Mycobacterium tuberculosis SAR QSAR Environ Res. 2024 Jan;35(1):53-69.
  2. L. Mulyukin, D.Recchia, N.A. Kostrikina, M.V. Artyukhina, B.A.Martini, A.Stamilla, G.Degiacomi, E.G.Salina et al. Distinct Effects of Moxifloxacin and Bedaquiline on Growing and ‘Non-Culturable’ Mycobacterium abscessus. Microorganisms. 2023; 11(11): 2690.
  3. Martini B.A., Grigorov A.S., Skvortsova Y.V., Bychenko O.S., Salina E.G., Azhikina T.L. Small RNA MTS1338 Configures a Stress Resistance Signature in Mycobacterium tuberculosis. J. Mol. Sci. 2023, 24, 7928
  4. Salina EG, Postiglione U, Chiarelli LR, Recchia D, Záhorszká M, Lepioshkin A, Monakhova N, Pál A, Porta A, Zanoni G, Korduláková J, Kazakova E, Sassera D, Pasca MR, Makarov V, Degiacomi G. A new benzothiazolthiazolidine derivative, 11726172, is active in vitro, in vivo, and against nonreplicating cells of Mycobacterium tuberculosis. 2022. mSphere. e0036922.
  5. Koumpoura CL, Nguyen M, Bijani C, Vendier L, Salina EG, Buroni S, Degiacomi G, Cojean S, Loiseau PM, Benoit-Vical F, García-Sosa AT, Anne Robert, Baltas M. Design of Anti-infectious Agents from Lawsone in a Three-Component Reaction with Aldehydes and Isocyanides. 2022. ACS Omega. 7(40):35635-35655.
  6. Salina EG, Makarov V. Mycobacterium tuberculosis Dormancy: How to Fight a Hidden Danger. 2022. Microorganisms. 10 (12). P. 2334.
  7. Egorova A, Salina EG, Makarov V. Targeting Non-Replicating Mycobacterium tuberculosis and Latent Infection: Alternatives and Perspectives. Int J Mol Sci. 2021 22(24):13317.
  8. Grigorov A, Bychenko O, Salina EG, Skvortsova Y, Mazurova A, Skvortsov T, Kaprelyants A, Azhikina T. Small RNA F6 Provides Mycobacterium smegmatis Entry into Dormancy. Int J Mol Sci. 2021 22(21):11536.
  9. Bychenko O., Skvortsova Y., Ziganshin R., Grigorov A., Aseev L., Ostrik A., Kaprelyants A., Salina E.G., Azhikina T. Mycobacterium tuberculosis Small RNA MTS1338 Confers Pathogenic Properties to Non-pathogenic Mycobacterium smegmatis. Microorganisms 2021, 9, 414.
  10. Monakhova N, Korduláková J, Vocat A, Egorova A, Lepioshkin A, Salina EG, Nosek J, Repková E, Zemanová J, Jurdáková H, Górová R, Roh J, Degiacomi G, Sammartino JC, Pasca MR, Cole ST, Mikušová K, Makarov V. Design and Synthesis of Pyrano[3,2-b]indolones Showing Antimycobacterial Activity. ACS Infect Dis. 2021; 7(1):88-100.
  11. А. А. Острик, Т. Л. Ажикина, Е. Г. Салина. Малые некодирующие РНК и их роль в патогенезе Mycobacterium tuberculosis. Успехи биологической химии. 2021, том 61, с. 229-253
  12. Makarov V, Salina E, Reynolds RC, Kyaw Zin PP, Ekins S. Molecule Property Analyses of Active Compounds for Mycobacterium tuberculosis. J Med Chem. 2020, 63, 17, 8917–8955
  13. А. А. Острик, Е. Г. Салина, Ю. В. Скворцова, А. С. Григоров, О. С. Быченко, А. С. Капрельянц, Т. Л. Ажикина. Малые РНК Mycobacterium tuberculosis в адаптации к стрессовым условиям, моделирующим инфекцию in vitro. Прикладная биохимия и микробиология. том 56, № 4, с. 336–341
  14. Chiarelli LR., Salina EG., Mori G, Azhikina T, Riabova O, Lepioshkin A, Grigorov A, Forbak M, Madacki J, Orena BS, Manfredi M, Gosetti F, Buzzi A, Degiacomi G, Sammartino JC, Marengo E, Korduláková J, Riccardi G, Mikušová K, Makarov V, Pasca MR. New insights into the mechanism of action of the thienopyrimidine antitubercular prodrug TP053. ACS Infect dis 2020; 6(2):313-323.
  15. Skvortsova YV, Salina EG, Burakova EA, Bychenko OS, Stetsenko DA, Azhikina TL. A new Antisense Phosphoryl Guanidine Oligo-2′-O-Methylribonucleotide Penetrates Into Intracellular Mycobacteria and Suppresses Target Gene Expression. Front Pharmacol. 2019, 10:1049.
  16. Salina EG, Grigorov A, Skvortsova Y, Majorov K, Bychenko O, Ostrik A, Logunova N, Ignatov D, Kaprelyants A, Apt A, Azhikina T. MTS1338, A Small Mycobacterium tuberculosisRNA, Regulates Transcriptional Shifts Consistent With Bacterial Adaptation for Entering Into Dormancy and Survival Within Host Macrophages. Front Cell Infect Microbiol. 2019, 9:405.
  17. Salina EG, Grigorov AS, Bychenko OS, Skvortsova YV, Mamedov IZ, Azhikina TL, Kaprelyants AS. Resuscitation of dormant «non-culturable» Mycobacterium tuberculosisis characterized by immediate transcriptional burst. Front Cell Infect Microbiol 2019, 9:272.

 

Услуги

УСЛУГИ 
  • Определение антибактериальной активности химических соединений (минимальная ингибирующая концентрация, бактерицидное/бактериостатическое действие) в отношении широкого спектра бактерий in vitro и ex vivo.