Биоразнообразие, метаболизм и геохимическая деятельность микроорганизмов
Создание и поддержание коллекций новых прокариот с исследованным метаболизмом, в том числе экстремофильных, в качестве банка генов для различных задач и направлений биотехнологии;
Направленный поиск и культивирование новых микроорганизмов-экстремофилов – продуцентов высокостабильных ферментов для биотехнологии (пищевая, целлюлозно-бумажная, текстильная промышленность, производство детергентов);
Исследование природных микробных сообществ с целью обнаружения продуцентов новых ферментов для биотехнологии среди некультивируемых микроорганизмов;
Исследование разнообразия и экологии вирусов прокариот и растений, в том числе с точки зрения возможного применения в медицине и биотехнологии;
Исследования в области эволюции прокариот на основе сравнительного анализа рибосомальных генов и генов, кодирующих ключевые ферменты основных метаболических путей;
Изучение метаболизма новых микроорганизмов, в том числе с применением методов сравнительной геномики, с целью поиска путей получения энергоносителей (биотоплива) и продуктов с повышенной добавленной стоимостью;
Создание микробных топливных элементов на основе новых микроорганизмов, восстанавливающих нерастворимые акцепторы электронов;
Поиск микроорганизмов-продуцентов новых веществ с антимикробной и цитостатический активностью;
Изучение разнообразия и метаболизма грибов – продуцентов биологически активных соединений.