На базе структурных подразделений ФИЦ Биотехнологии РАН организуются и проводятся на постоянной основе научные мероприятия, в том числе международные — конкурсы, чтения, семинары, конференции, симпозиумы и др., большинство из которых направлены на повышения образования молодых ученых, стимулирование их научной деятельности, а так же обсуждение наиболее актуальных вопросов и проблем современной биотехнологической науки.

Ежегодно с 1944 года в Институте биохимии им. А.Н. Баха в день рождения академика Алексея Николаевича Баха, 17 марта, проводятся научные чтения, посвященные крупным проблемам биохимии. В 1946 году учреждена Премия имени академика А.Н. Баха, которая присуждается Президиумом Российской академии наук за выдающиеся научные труды, научные открытия и изобретения в области биохимии один раз в три года.

Традиционно один раз в год Институт биохимии им. А.Н. Баха проводит научную конференцию с целью развития научно-исследовательских работ Института, обмена информацией о результатах научных исследований, ведущихся в Институте. На конференции представляются научные сообщения, выполненные в лаборатории/группе по одной проблеме в рамках тематики лаборатории. На конференции могут быть представлены работы, выполненные с участием других организаций, при условии, что сотрудникам Института принадлежала ведущая роль в их выполнении.

Ежегодно присуждается стипендия имени В.Л. Кретовича лучшим аспирантам Центра по специальности биохимия и биотехнология. Стипендия выдается по результатам аттестации аспирантов после 2-го года обучения о проделанной работе.

Научные чтения имени выдающегося российского микробиолога С.Н. Виноградского учреждены в 2009 году и проводятся в Институте микробиологии им. С.Н. Виноградского. Премия имени С. Н. Виноградского — научная награда Российской академии наук, присуждается за выдающиеся работы в области общей микробиологии.

Молодежная школа-конференция с международным участием «Актуальные аспекты современной микробиологии» – мероприятие, традиционно проводимое в Институте микробиологии им. С.Н. Виноградского, с 2004 года. Главной целью международной школы-конференции являются обмен идеями, обсуждение наиболее актуальных вопросов и проблем современной микробиологии, микробной экологии, биогеохимии и биотехнологии. С тематическими лекциями выступают ведущие специалисты-микробиологи. На конференции представляются устные и стендовые доклады молодых ученых (возраст до 35 лет) из ведущих научных учреждений и университетов России и стран ближнего зарубежья по тематикам, заявленным в программе конференции.

Ежегодно Институт биоинженерии совместно с Российским Хитиновым Обществом проводит Шорыгинские хитиновые чтения с вручением премии молодым ученым-хитинологам (до 28 лет).

В рамках научно-образовательного проекта «Кадры для биоинженерии» Институт биоинженерии проводит ежегодные студенческие школы-семинары, в которых за 10 лет приняли участие более 400 студентов из 30 региональных ВУЗов.

ФИЦ Биотехнологии РАН принимает участие в организации Всероссийского молодежного форума «Шаг в будущее» — участвует в составе экспертного жюри, отвечает за проведению секции «Системная биология и биотехнология», принимает участие в организации олимпиады школьников в Москве, выступает с лекциями, раскрывая современные аспекты биотехнологии и молекулярной биологии, проводит семинары (консалтинги) по разным научным направлениям.