Лаборатория молекулярного имиджинга


Жердева Виктория Вячеславовна

Заведующая лабораторией
кандидат биологических наук
ИНБИ, корп. 2, ком. 118
E-Mail vjerdeva@inbi.ras.ru

Основное

ОПИСАНИЕ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ ЛАБОРАТОРИИ

Ключевые слова
молекулярная визуализация, флуоресцентный имиджинг с временным разрешением, магнитно-резонансная томография, протеиназы, флуоресцентные цветные белки,  генетически-кодируемые сенсоры,  воспаление, канцерогенез

Краткая история лаборатории
Лаборатория молекулярного имиджинга  сформирована  в 2018 году на базе ФИЦ Биотехнологии РАН в соответствии с Постановлением №220  Правительства РФ от 09.04.2010 для выполнения работ по гранту № 14.W03.31.0023 Минобрнауки России «​​​​​Визуализация и инженерия эукариотических геномов» в  рамках подпрограммы «Институциональное развитие научно-исследовательского сектора» государственной программы Российской Федерации «Развитие науки и технологий» на 2013 – 2020 годы.

КАРТОЧКА ПРОЕКТА «​​​​​Визуализация и инженерия эукариотических геномов»

 

Направления исследований
Лаборатория молекулярной визуализации была создана с целью решения ряда важных научных проблем, связанных с медицинской биотехнологией и нанотехнологиями. Исследователи, участвующие в проекте, имеют видные международные позиции в своих областях и являются экспертами в своих областях, то есть неинвазивной визуализации в живых системах, биофизике, биохимии и конструировании флуоресцентных белков, а также радиологии. Мы создали междисциплинарную исследовательскую группу, чтобы получить прорывные результаты в рамках нескольких взаимосвязанных направлений исследований на стыке молекулярной биологии, биофизики и медицины. Основная цель лаборатории – прорывные исследования в области картирования эукариотического генома с использованием мультимодальных / томографических и междисциплинарных подходов. Лаборатория активно занимается исследованиями по следующим направлениям:

  •  разработка биоинженерных подходов для создания молекул флуоресцентных сенсоров на основе мутантов, происходящих из эндонуклеаз семейства Cas;
  •  применение достижений лаборатории ведущего ученого в области нанотехнологий для доставки рекомбинантных молекул и вирусных конструкций с целью регулируемой экспрессии сенсоров на основе CRISPR / Cas9 в клетках и тканях экспериментальных животных;
  • использование пикосекундной лазерной технологии для изучения времени жизни флуоресценции рекомбинантных сенсорных молекул в контексте нацеливания на геномную ДНК;
  • создание технологии гибридной визуализации, которая сочетает в себе магнитно-резонансную томографию и флуоресцентную визуализацию времени жизни во временной области.

 

Достижения

ОСНОВНЫЕ ДОСТИЖЕНИЯ

1) Впервые созданы лентивирусные векторы-переносчики для доксициклин регулируемой экспрессии химерных белков на основе каталитически неактивного мутанта эндонуклеазы Cas9 (dCas9);

2) Проведены эксперименты по коэкспрессии и локализации в ядре клеток химерных белков на основе ортологов dCas9  а также in vivo  в подкожных ксенографтах опухолей на мышах nude;

3) Проведена установка и введение в эксплуатацию исследовательского некриогенного прибора для доклинического МРТ;

4) С помощью МРТ проведено исследование распределения смесей, просветляющих поверхность кожи, в подкожных тканях;

5) По результатам исследований за период 2019-2020 гг. опубликовано 19 работ в журналах, индексируемых WoS (Q1–Q4).

В период с 29 сентября по 2 октября 2020 года была проведена международная конференция «Towards optical and multimodality translational imaging» (TOMTI’20). Конференция организована в дистанционном формате и прошла совместно с ежегодной конференцией Саратовского Государственного Университета «XXIV Аnnual Saratov Fall Meeting». В мероприятиях приняли участие 628 человек.

Проведена 4-я Международная школа по перспективным методам флуоресцентного имиджинга ADFLIM на базе СГУ с 23 по 27 сентября 2019 г. совместно с XXIII Международной школой для студентов и молодых ученых по оптике, лазерной физике и биофотонике.  Слушатели научно-образовательных школ приняли участие также в работе Международного симпозиума «Оптика и биофотоника ‑ VII», который был организован СГУ и ФИЦ Биотехнологии РАН с 24 по 27 сентября 2019 г.
Информация о школе размещена на сайте: http://www.adflim.org/4_ya_shkola_adflim.html
Информация о мероприятиях размещена на сайте СГУ: https://www.sgu.ru/structure/fiz/saratov-fall-meeting

Результаты исследований представлены на III Международной научной конференции «Наука будущего» и IV Всероссийском форуме «Наука будущего – наука молодых». О проведении работ по проекту договора №14.W03.31.0023 Министерства науки и высшего образования РФ выступил руководитель лаборатории молекулярного имиджинга ведущий ученый Богданов А.А. Он принимал участие в Круглом столе для обсуждения стратегии Мегагрантов на 2020-2025 г, а также участвовал в жюри экспертов по оценке работ (проектных команд) молодых ученых по секции «Медицина и Фармакология».

На конференции SPIE Photonics West (San Francisco CA) 2-2-2020 и конференции SPIE Photonics Europe Digital Forum (Франция) Богдановым АА и сотрудники коллектива выступили с докладами, в том числе в онлайн формате.

Коллективом продолжаются работы по разработке сочетанной визуализации (МРТ  и флуоресцентный имиджинг) геномных сайтов на основе флуоресцентных  рекомбинантных сенсоров CRISPR / Cas9 в клетках и тканях экспериментальных животных.

В апреле 2022 года коллектив лаборатории стал победителем конкурса «Проведение фундаментальных научных исследованийи поисковых научных исследований отдельными научными группами» на получение гранта Российского научного фонда по теме : «Инженерия зондов для бимодальной флуоресцентной и магнитно-резонансной визуализации специфических сайтов геномного редактирования в живых клетках и тканях», грант РНФ № 22-14-00205.

Кроме того,  на базе лаборатории проводятся исследования по изучению биодеградации сополимеров, предназначенных для создания трибоэлектрических наногенераторов  («Биорезорбируемые имплантируемые устройства на основе трибоэлектрических наногенераторов» 2021-2023г.г. совместно с организациями  из  стран-членов  ЕС  в  рамках  многостороннего сотрудничества  в  программе  «Горизонт-2020»,   включая  инициативы  ЭРА- НЕТ, грант  МОН № 13.2251.21.0009, Соглашение № 075-15-2021-942).

 

Сотрудники

СОСТАВ ЛАБОРАТОРИИ

ФИО Ученая степень, звание Должность Место работы Городской телефон Внутренний телефон E-mail
1Жердева
Виктория Вячеславовна
к.б.н.зав. лабораториейИНБИ, корп. 2, ком. 118(495) 660-34-30 468vjerdeva@inbi.ras.ru
2Абушинова
Герел Адьяновна
-м.н.с.---gerelabushinova@yandex.ru
3Гук
Елизавета Александровна
-м.н.с.---lizochckaguck@yandex.ru
4Деева
Виктория Викторовна
-ст. лаборантИНБИ, корп. 2, комн. 116(495) 660-34-30468vikadeeva100@yandex.ru
5Казачкина
Наталия Ивановна
к.б.н.с.н.с.ИНБИ, корп. 2, комн. 116(495) 660-34-30 468nkazachkina@inbi.ras.ru
6Потапов
Константин Владиславович
-м.н.с.- --kospotapov@yandex.ru
7Сайдашева
Асия Нигматжановна
-ст. лаборантИНБИ, корп. 2, комн. 118(495) 660-34-30468asiya.saydasheva@gmail.com

 

КАРТОЧКА ПРОЕКТА «​​​​​Визуализация и инженерия эукариотических геномов»

Оборудование

УНИКАЛЬНОЕ ОБОРУДОВАНИЕ

В конце мая 2019 в рамках выполнения работ по проекту №14.W03.31.0023 Министерства науки и высшего образования РФ в помещении лаборатории Молекулярного имиджинга ИНБИ (корп. 2, комн. 120) был установлен и введен в эксплуатацию новейший прибор М3™ для доклинической магнитно- резонансной томографии (МРТ). Прибор произведен компанией Aspect Imaging (Шохам, Израиль) и предназначен для визуализации деталей анатомии и физиологии экспериментальных животных (грызунов весом до 30 г).

М3™ МРТ сконструирован на основе компактного высокоэффективного постоянного магнита с напряженностью магнитного поля 1 Тесла, который не требует криогенного обеспечения. Данная МРТ установка представляет собой пока единственную в России систему, и одну из примерно 100 доклинических МРТ систем, установленных в ведущих научно- исследовательских и R&D центрах мира.

Томографические изображения, полученные при использовании данной МРТ установки, основаны на различиях во временах релаксации и концентрации протонов молекул, в большом количестве присутствующих в тканях живых организмов. Данные изображения могут быть получены с высоким объёмным разрешением (т.е. объёмом вокселя), достигающим долей кубического миллиметра (микролитра).

В систему входят система для анестезии и иммобилизации животного, система физиологического мониторинга, а также все необходимые компоненты для получения, регистрации, сбора данных и их анализа, включая компьютерное обеспечение для регистрации изображений, получаемых в многоканальных, мульти модальных режимах работы, в том числе в сочетании с позитронно-эмиссионной и оптической томографией.

Данная система удовлетворяет высоким потребностям лаборатории в объединении подходов по  получению  МРТ-изображений и флуоресцентных изображений на одном и том же экспериментальном животном для решения задач по визуализации  и локализации различных процессов в живом организме в динамике, в норме и патологии.

Публикации

ЗНАЧИМЫЕ ПУБЛИКАЦИИ

ОТЕЧЕСТВЕННЫЕ ГРАНТЫ И ХОЗДОГОВОРА (2014-2015гг.)

№ пп Наименование работы № лота, контракта, соглашения, субсидии Финансирующая организация Наименование программы Период проведения работ Соисполнитель Руководитель работ
1. Синтез потенциальных ингибиторов матриксной металлопротеиназы-2 и изучение их свойств in vitro и in vivo 14-04-01266 Российский фонд фундаментальных исследований 2014-2016 Жердева В.В.
2. Изучение закономерностей воздействия фотодинамической терапии на злокачественные клетки и опухоли на молекулярно-биохимическом уровне 14-02-00934 Российский фонд фундаментальных исследований 2014-2016 Меерович И.Г
3. Разработка метода прижизненной визуализации протеиназной активности в опухолях in vivo 14-08-01017 Российский фонд фундаментальных исследований 2014-2016 Казачкина Н.И.
4. Флуоресцентные сенсоры нового поколения для детекции протеолитической активности в живых клетках и организмах 13-04-40305-Н РФФИ-КОМФИ 2013-2015 ИБХ Савицкий А.П.
5. Изучение структуры и спектрально-флуоресцентных свойств цветных флуоресцирующих белков из кораллов и создание на их основе клеточных сенсоров для субдифракционной сверхразрешающей молекулярной визуализации биохимических процессов в клетках Президиум РАН Молекулярная и клеточная биология 2014-2018 Савицкий А.П.
6. Современные методы молекулярного флуоресцентного имиджинга с высоким пространственным и временным разрешением 15-14-30019 Российский научный фонд Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований с представлением результатов в рамках международной конференции (конгресса 2014-2017 Савицкий А.П.

 

Статьи в научных изданиях, индексируемых в базе данных WoS (по результатам 2019-2022):

  • Bogdanov A.A., Tuchin V.V., Meerovich I.G., Kazachkina N.I., Zherdeva V.V., Solovyev I.D., Tuchina D.K., Savitsky A.P. Towards registration of optical and MR signal changes in subcutaneous tumor volume in vivo after optical skin clearing.  В сборнике: Progress in Biomedical Optics and Imaging — Proceedings of SPIE. Сер. «Dynamics and Fluctuations in Biomedical Photonics XVII» 2020. С. 112390N. (SJR IF 0,27)
  • Bogdanov AA Jr, Meerovich I, Kazachkina N, Zherdeva V,  Solovyev I,  Tuchina DK, Savitsky AP, Tuchin VV. Optical clearing effects in subcutaneous red-fluorescent tumors monitored by fluorescence and magnetic resonance imaging in vivo (Conference Presentation). SPIE Proceedings Volume 11363, Tissue Optics and Photonics; 113630S (2020) https://doi.org/10.1117/12. 2560186 SPIE Photonics Europe, 2020, Online Only, France April 6-8 (SJR IF 0,27)
  • Daria K. Tuchina, Irina G. Meerovich,  Olga A. Sindeeva,  Victoria V. Zherdeva,  Alexander P. Savitsky,  Alexei A. Bogdanov, Jr  Valery V. Tuchin. Magnetic resonance contrast agents in optical clearing: Prospects for multimodal tissue imaging. J.Biophotonics. 2020  https://doi.org/10.1002/jbio. 201960249 (2021-SJR Q1 IF 0,8)
  • A.A. Bogdanov Jr., N.I. Kazachkina, V.V. Zherdeva, I.G. Meerovich, D.K. Tuchina, I.D. Solov’ev, A.P. Savitsky, V.V. Tuchin Optical clearing and multimodality fluorescence and magnetic resonance imaging in cancer models Proceedings of SPIE, 2021, Vol. 11641, P.1-8 DOI: 10.1117/12.2586113 (SJR IF 0,18)
  • Kazachkina NI, Zherdeva VV,   Saydasheva AN, Meerovich IG, Tuchin VV , Savitsky AP, Bogdanov AA Jr.Topical Gadobutrol Application Causes Fluorescence Intensity Change in RFP-expressing Tumor-Bearing Mice. J. Biomedical Photonics & Eng 2021 7(2) 020301-1. (2021 — SJR Q2 IF 0.39)
  • Tuchina DK, Meerovich IG, Sindeeva OA, Zherdeva VV, Kazachkina NI, Solov’ev ID, Savitsky AP, Bogdanov AA Jr., Tuchin VV. Prospects for multimodal visualisation of biological tissues using fluorescence imaging. Quantum Electron 2021 51(2) 104. ( 2021- SJR Q2 IF 0.4)
  • Bogdanov AA Jr, Kazachkina NI, Zherdeva VV, Meerovich IG, Tuchina DK,  Solovyev ID, Savitsky AP, Tuchin V.V. Magnetic resonance imaging study of diamagnetic and paramagnetic agents for optical clearing of tumor-specific fluorescent signal in vivo. Chapter 15 In: Tissue optical clearing: new prospects in optical imaging (Valery Tuchin, Dan Zhu, Elina A. Genina(Eds.) CRC Press, Boca Raton, FL  2022.
  • Л.Г. Малошенок, Г. А. Абушинова, А. Ю. Рязанова,С. А. Брускин, В. В.Жердева. Визуализация нуклеома на основе системы CRISPR–Cas9: oт in vitro к in vivo.  Успехи биологической химии, т. 62, 2022, с. 245–300
  • N.I. Kazachkina, V.V. Zherdeva, I.G. Meerovich, A.N. Saydasheva, I.D. Solov’ev V.V. Tuchin, A.P. Savitsky, and A.A. Bogdanov Jr. MR and fluorescence imaging of gadobutrol‐induced optical clearing of red fluorescent protein signal in an in vivo cancer model. NMR in Biomedicine, 2022, e4708, p.1-12, DOI: 10.1002/nbm.4708
  • N.I. Kazachkina, V.V. Zherdeva1, A.N. Saydasheva, I.G. Meerovich, V.V. Tuchin, A.P. Savitsky, and A.A. Bogdanov Jr. Topical Gadobutrol Application Causes Fluorescence Intensity Change in RFP-expressing Tumor-Bearing Mice. Journal of Biomedical Photonics & Engineering, 2021, 020301, Р.1-7 DOI: 10.18287/JBPE20.07.020301
  • D.K. Tuchina, I.G. Meerovich, O.A. Sindeeva, V.V. Zherdeva, N.I. Kazachkina, I.D. Solov’ev, A.P. Savitsky, A.A. Bogdanov Jr., V.V. Tuchin Prospects for multimodal visualisation of biological tissues using fluorescence imaging Quantum Electronics, 2021, Vol. 51, № 2, P.104– 117 DOI: 10.1070/QEL17512
  • T.Bäuerle, S.Gupta, S.Zheng, L.Seyler, A.Leporati, M.Marosfoi, S. Maschauer, O.Prante, P.Caravan, A.Bogdanov Jr. Multimodal Bone Metastasis-associated Epidermal Growth Factor Receptor Imaging in an Orthotopic Rat Model Radiology: Imaging Cancer, 2021, Vol. 3, № 4, e200069, P.1-13 DOI: 10.1148/rycan.2021200069
  • N.Kazachkina, J.Lymar, V.Shcheslavsky, A.Savitsky. A pilot study of the dynamics of tissue oxygenation in vivo using time-resolved phosphorescence imaging Journal of Innovative Optical Health Sciences, 2021, 2142001, P.1-10 DOI: 10.1142/S1793545821420013
  • A.A. Bogdanov Jr., N.I. Kazachkina, V.V. Zherdeva, I.G. Meerovich, D.K. Tuchina, I.D. Solov’ev, A.P. Savitsky, V.V. Tuchin Optical clearing and multimodality fluorescence and magnetic resonance imaging in cancer models Proceedings of SPIE, 2021, Vol. 11641, P.1-8 DOI: 10.1117/12.2586113
  • A.A. Bogdanov Jr., V.V. Tuchin, I.G. Meerovich, N.I. Kazachkina, V.V. Zherdeva, I.D. Solov’ev, D.K. Tuchina, A.P. Savitsky Towards registration of optical and MR signal changes in subcutaneous tumor volume in vivo after optical skin clearing Proceedings of SPIE, 2020, 112390N, Vol. 11239, P.1-8 DOI: 10.1117/12.2545312
  • D.K. Tuchina, O.A. Sindeeva, A.P. Savitsky, A.A. Bogdanov Jr., V.V. Tuchin In vivo application of magnetic resonance imaging contrast agents for tissue optical clearing Proceedings of SPIE, 2020, 1136327, Vol. 11363, P.1 DOI: 10.1117/12.2557365
  • A.A. Bogdanov Jr., I.G. Meerovich, N.I. Kazachkina, V.V. Zherdeva, I.D. Solov’ev, D.K. Tuchina, A.P. Savitsky, V.V. Tuchin Optical clearing effects in subcutaneous red-fluorescent tumors monitored by fluorescence and magnetic resonance imaging in vivo Proceedings of SPIE, 2020, Vol. 11363, P.1 DOI: 10.1117/12.2560186
  • V.G.Metelev, A.A. Bogdanov Jr. Synthesis and applications of theranostic oligonucleotides carrying multiple fluorine atoms Theranostics, 2020, Vol.10, № 3, P. 1391- 1414 DOI: 10.7150/thno.37936
  • D.K. Tuchina, I.G. Meerovich, O.A. Sindeeva, V.V. Zherdeva, A.P. Savitsky, A.A. Bogdanov Jr., V.V. Tuchin Magnetic Resonance Contrast Agents in Optical Clearing: Prospects for Multimodal Tissue Imaging Journal of Biophotonics, 2020, e201960249, P. 1-19 DOI: 10.1002/jbio.201960249
  • Bogdanov AA, Solovyev ID, Savitsky AP. Sensors for Proteolytic Activity Visualization and Their Application in Animal Models of Human Diseases. Biochemistry-Moscow 2019, Vol.84, Supplement1, S1-S18. (WoS, Q4,  I F 1.724,  SJR 0.16)
  • Sdobnov AY,   Lademann J, Darvin ME, Tuchin VV. Sensors for Proteolytic Activity Visualization and Their Application in Animal Models of Human Diseases, Biochemistry-Moscow, Vol.84, Supplement1, S144-S158. WoS, Q4,  I F 1.724,  SJR 0.16)
  • Sdobnov AY, Darvin ME, Schleusener J, Lademann J, Tuchin VV. Hydrogen bound water profiles in the skin influenced by optical clearing molecular agents- quantitative analysis using confocal Raman microscopy. J Biophotonics 2019 May;12(5):e201800283, doi: 10.1002/jbio.201800283
  • Xie Q., Zeng N., Huang Y., Tuchin V. V., Ma H. Study on the tissue clearing process using different agents by Mueller matrix microscope. Biomed. Opt. Express.2019. 10(7), 3269–3280
  • Leporati A., Gupta S., Bolotin E., Castillo G., Alfaro J., Gottikh M.B., Bogdanov A.A. Jr. Antiretroviral Hydrophobic Core Graft-Copolymer Nanoparticles: The Effectiveness against Mutant HIV-1 Strains and in Vivo Distribution after Topical Application . Pharm. Res. 2019,  36 (5):73. doi: 10.1007/s11095-019-2604-9
  • Munkhbat O., Canakci M., Zheng S., Hu W., Osborne B., Bogdanov A.A., Thayumanavan S. 19F MRI of Polymer Nanogels Aided by Improved Segmental Mobility of Embedded Fluorine Moieties. Biomacromolecules 2019, 20( 2): 790-800. https://doi.org/10.1021/acs.biomac.8b01383
  • Rodríguez-Rodríguez A., Shuvaev S., Rotile N., Jones C.M., Probst C.K., Ferreira D.D.S., Graham-O′Regan K., Boros E., Knipe R.S., Griffith J.W., Tager A.M., Bogdanov Jr. A.A., Caravan P. Peroxidase Sensitive Amplifiable Probe for Molecular Magnetic Resonance Imaging of Pulmonary Inflammation. ACS Sens. 2019, 4(9): 2412-2419, https://doi.org/10.1021/acssensors.9b01010
  • Carneiro I, Carvalho S, Henrique R, Oliveira L, Tuchin V. Moving tissue spectral window to the deep-ultraviolet via optical clearing. J. Biophotonics. 2019, 12 (12), e201900181. https:// doi.org/10.1002/jbio.201900181

 

Публикации в книгах:

  • A.A. Bogdanov Jr., N.I. Kazachkina, V.V. Zherdeva, I.G. Meerovich, D.K. Tuchina, I.D. Solov’ev, A.P. Savitsky, V.V. Tuchin. Magnetic resonance imaging study of diamagnetic and paramagnetic agents for optical clearing of tumor-specific fluorescent signal in vivo

 

Монографии:

  • A.A. Bogdanov Jr., N.I. Kazachkina, V.V. Zherdeva, I.G. Meerovich, D.K. Tuchina, I.D.Solov’ev, A.P. Savitsky, V.V. Tuchin. Magnetic resonance imaging study of diamagnetic and paramagnetic agents for optical clearing of tumor-specific fluorescent signal in vivo. Handbook of Tissue Optical Clearing: New Prospects in Optical Imaging. 2022, CRC Press, pp. 459-470, DOI: 10.1201/9781003025252 (глава в монографии)
  • Handbook of Tissue Optical Clearing. New Prospects in Optical Imaging. Edited By Valery Tuchin, Dan Zhu, Elina A. Genina. Chapter25. CRC Press. 2021 (глава в монографии)
  • Oliveira L. and Tuchin V. V.  The optical clearing method: A new tool for Clinical Practice and Biomedical Engineering, Basel: Springer Nature Switzerland AG, 2019. ISBN 978-3-030-33054-5

 

Результаты интеллектуальной деятельности:

Тучин В.В., Тучина Д.К., Савицкий А.П., Богданов А.А. Способ визуализации биологических тканей и/или органовПатент РФ № RU 2735463Заявка на международный патент РСТ/2009/050259

 

Материалы конференций:

  •  Bogdanov AA Jr, Tuchin VV, Meerovich IG, Kazachkina NI, Zherdeva VV, Solovyev ID, Tuchina DK, Savitsky AP. Towards registration of optical and MR signal changes in subcutaneous tumor volume in vivo after optical skin clearing. Dynamics and Fluctuations in Biomedical Photonics XVII 112390N, SPIE Digital Library. 2020
  • Salem S. F., Tuchin V. V., «Theoretical study of the blood stream in a tube in the presence of a steady-state magnetic field,» Proc. SPIE 11067, Saratov Fall Meeting 2018: Computations and Data Analysis: from Nanoscale Tools to Brain Functions, 1106716 (3 June 2019).
  • Selifonov A.A., ShapovalO. G.,  Yuvchenko S. A., Zimnyakov D. A., Mikerov A. N., Tuchin V. V. «Clinical studies of the combined action of ultraviolet and laser (662 nm) radiation with methylene blue for local therapy of defects of oral mucosa in chronic recurrent aphthous stomatitis,» Proc. SPIE 11065, Saratov Fall Meeting 2018: Optical and Nano-Technologies for Biology and Medicine, 1106519 (3 June 2019).
  • Bogdanov A.A. Jr., Metelev V.G., Taghian T., Solovyev I., Kumar A.T.N, Zhang S., Savitsky A.Р. Near-infrared oligonucleotide duplex sensors for imaging rapidly activated transcription factors in vitro and in situ . Proc. SPIE 10877, Dynamics and Fluctuations in Biomedical Photonics XVI. 2019. 1087702; doi: 10.1117/12.2511124.

 

Участие в мероприятиях:

Устные доклады

  • A.Bogdanov Jr. Towards registration of optical and MR signal changes in subcutaneous tumor volume in vivo after optical skin clearingМеждународный конгресс SPIE. Photonics West Сан-Франциско, США, 1-6 февраля 2020 г.
  • A.A. Bogdanov Jr., N.I. Kazachkina, I.G. Meerovich, V.V. Zherdeva, D.K. Tuchina, I.D. Solov’ev, V.V. Tuchin, A.P. Savitsky  Magnetic resonance imaging enables tracking of tissue optical clearing effects during red fluorescent marker protein imaging Международный конгресс World Molecular Imaging Congress 2020 Culver City, США, 7-9 октября 2020 г.
  • A.A. Bogdanov Jr., I.G. Meerovich, N.I. Kazachkina, V.V. Zherdeva, I.D. Solov’ev, D.K. Tuchina, A.P. Savitsky, V.V. Tuchin. Optical clearing effects in subcutaneous red-fluorescent tumors monitored by fluorescence and magnetic resonance imaging in vivo Международный конгресс SPIE Photonics Europe Страсбург, Франция, 29 марта — 2 апреля 2020 г.
  • A.Bogdanov. Magnetic Resonance Imaging and Optical Clearing Международный конгресс Saratov Fall Meeting SFM’20. Включает «8th International Symposium “Optics and Biophotonics”, «24th International school for junior scientist and students on Optics, Laser Physics and Biophotonics”, конференцию ”Towards Optical and Multimodality Translational Imaging TOMTI-20”, “Chinese-Russian Workshop on Biophotonics and Biomedical Optics ChRW-2020”. г. Саратов, 28 сентября — 2 октября 2020 г.
  • Bogdanov AA Jr, Meerovich I, Kazachkina N, Zherdeva V,  Solovyev I,  Tuchina DK,  Savitsky AP, Tuchin VV. Optical clearing effects in subcutaneous red-fluorescent tumors monitored by fluorescence and magnetic resonance imaging in vivo. SPIE Photonics Europe Digital Forum, France, 2020, (Conference Online Presentation).
  • Bogdanov A.A.  Time-resolved fluorescence for detecting of rapidly activated transcription factor interaction with the near-infrared oligonucleotide probes in vitro and in situ: Conference 10877.  Dynamics and Fluctuations in Biomedical Photonics XVI. SPIE West BIOS, The Moscone Center,  San Francisco CA,  February 3, 2019   (invited keynote presentation).
  • Bogdanov A.A. Molecular imaging sensors for inflammatory biomarkers.   Trans-NIH Conference on Imaging Inflammation and its Resolution in Health and Diseases by National Institutes of Health, Rockville MD, June 10-11, 2019 (Invited paper).
  • Богданов А.А., Метелев В.Г., Тажьян Т. [и др.] II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды», (01-6 октября 2019 г., г. Сочи, Дагомыс). Молекулярная визуализация воспалительных процессов с помощью сенсорных молекул. (Keynote presentation).
  • В.В. Тучин,  И.Г. Меерович,  Д.К. Тучина [и др.]. II Объединенный научный форум: VI Съезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды» (01-6 октября 2019 г., г. Сочи-Дагомыс). Скрытая диффузия молекул оптических просветляющих агентов: достоинства и недостатки при оптической визуализации патологий (Keynote presentation).

Постеры

  • D.K. Tuchina, O.A. Sindeeva, A.P. Savitsky, A.A. Bogdanov Jr., V.V. Tuchin In vivo application of magnetic resonance imaging contrast agents for tissue optical clearing Международный конгресс SPIE Photonics Europe Страсбург, Франция, 29 марта — 2 апреля 2020 г.
  • V.V. Zherdeva, N.I. Kazachkina, I.G. Meerovich, D.K. Tuchina, V.V. Tuchin, A.P. Savitsky, A.A. Bogdanov Jr. Tissue optical clearing monitoring by fluorescence and magnetic resonance imaging in vivo Международный конгресс European Molecular Imaging Meeting — EMIM 2020 Греция, 24-28 августа 2020 г.
  • G.Abushinova, L.Maloshenok, V. Zherdeva, S.Bruskin, A.Savitsky, A.Bogdanov Jr. Lentiviral Tet-On system for inducible expression of the fluorescent chimeras of dCas9 orthologs and its application Международный конгресс Saratov Fall Meeting SFM’20. Включает «8th International Symposium “Optics and Biophotonics”, «24th International school for junior scientist and students on Optics, Laser Physics and Biophotonics”, ”Towards Optical and Multimodality Translational Imaging TOMTI-20”, “Chinese-Russian Workshop on Biophotonics and Biomedical Optics ChRW-2020”. г. Саратов, 28 сентября — 2 октября 2020 г.
  • A.Saydasheva, N.Kazachkina, V.Zherdeva, A.Savitsky, A.Bogdanov Jr. Planar imaging for preliminary assessment of optical clearing effect in tumor bearing mice Международный конгресс Saratov Fall Meeting SFM’20. Включает «8th International Symposium “Optics and Biophotonics”, «24th International school for junior scientist and students on Optics, Laser Physics and Biophotonics”, конференцию ”Towards Optical and Multimodality Translational Imaging TOMTI-20”, “Chinese-Russian Workshop on Biophotonics and Biomedical Optics ChRW-2020”. г. Саратов, 28 сентября — 2 октября 2020 г.
  • N.Chikalkin, D.Tuchina, O.Sindeeva, A.Savitsky, A.Bogdanov Jr., V.Tuchin. Optical clearing of mouse skin samples using MR and X-ray agents Международный конгресс Saratov Fall Meeting SFM’20. Включает «8th International Symposium “Optics and Biophotonics”, «24th International school for junior scientist and students on Optics, Laser Physics and Biophotonics”, конференцию ”Towards Optical and Multimodality Translational Imaging TOMTI-20”, “Chinese-Russian Workshop on Biophotonics and Biomedical Optics ChRW-2020”. г. Саратов, 28 сентября — 2 октября 2020 г.
  • Tuchina, DK,  Sindeeva, OA,  Savitsky, AP, Bogdanov, AAJr., Tuchin VV.  MRI contrast media as optical clearing agents: perspectives for tissue multimodal imaging International Conference on Laser Applications in Life Sciences (LALS) 18 – 20 Nov. 2018 Bar-Ilan Univ., Ramat-Gan  Israel.  Nov 19, 2019
  • Zhang, S., Zheng, S., Ding, L., Gupta, S., Fitzgerald, TJ, Bogdanov, AAJr.  In vivo tracking of nucleic acid gold nanoparticle theranostic compositions by near-infrared fluorescence imaging.  Abstract GA518. World Molecular Imaging Congress, Montreal CA, September 4-7, 2019.