Ярополов Александр Иванович
Заведующий лабораторией
доктор химических наук, профессор
ИНБИ, корп. 2, комн. 217
+7 (495) 954-44-77
yaropolov@inbi.ras.ru
Основное
Ключевые слова
биокатализ, биоэлектрокатализ, окислительно-восстановительные ферменты, ферментативный синтез композитных материалов, электропроводящие полимеры, лакказа-медиаторные системы, биокаталитическая трансформация, биосенсоры и биотопливные элементы, глубокие эвтектические растворители
Направления исследований
- Ферментативный синтез электропроводящих полимеров и композитов на их основе
- Биокаталитическая трансформация физиологически активных веществ
- Лакказа-медиаторные системы и их использование в биотехнологии
- Использование глубоких эвтектических растворителей в качестве среды для лакказа-катализируемых реакций полимеризации различных соединений, в том числе биологически активных, и для предобработки лигноцеллюлозного сырья с целью получения продуктов с добавленной стоимостью
Методы фундаментальных исследований:
- методы ферментативной кинетики
- биоэлектрохимические методы исследования электродных реакций
- хроматографические методы анализа
- просвечивающая и сканирующая электронная микроскопия
- спектральные методы исследований
- ЯМР спектроскопия
Краткая история лаборатории
Лаборатория была создана в 1986 г. Руководитель лаборатории – профессор, д.х.н. Ярополов Александр Иванович. В 1998 году лаборатория была переименована в лабораторию химической энзимологии.
Достижения
ОСНОВНЫЕ ДОСТИЖЕНИЯ
Основное направление деятельности лаборатории – изучение гомогенного и гетерогенного катализа медьсодержащими оскидазами, включая фундаментальные и прикладные аспекты. В настоящее время в лаборатории проводятся исследования по следующим направлениям: идентификация и расшифровка механизма действия оксидоредуктаз в гомогенных и гетерогенных системах; ферментативный синтез электропроводящих полимеров и композитов на их основе; биокаталитическая трансформация физиологически активных веществ с целью получения соединений с новыми свойствами; использование лакказа-медиаторных систем в различных областях биотехнологии; исследование возможности использования глубоких эвтектических растворителей для ферментативных реакций, а также для предобработки лигноцеллюлозного сырья.
- Предложена система отбора органических соединений – потенциальных редокс-медиаторов лакказ, которая значительно упрощает поиск новых медиаторов фермента. Найден новый класс медиаторов с общим названием 1-фенил-3-метил-пиразолоны-5. Показана возможность эффективного использования лакказа-медиаторных систем для делигнификации лигноцеллюлозы и деградации ксенобиотиков.
- Разработан лабораторный макет пористого газодиффузионного биокатода для топливного элемента на основе лакказы, иммобилизованной на высокодисперсных углеродных материалах. Показана высокая операционная стабильность ферментного электрода.
- Предложен подход для получения электропроводящих полимеров с участием лакказы в качестве катализатора окислительной свободно-радикальной полимеризации мономеров и редокс-медиаторов в качестве усилителей действия фермента. Такой подход позволяет проводить полимеризацию мономеров в мягких, экологически совместимых условиях, отвечающих требованиям «белой» биотехнологии.
- На основе ферментативно синтезированного полианилина и углеродных нанотрубок получен композитных материал, который был использован в качестве электроактивного компонента электродов в макете гибкого тонкого суперконденсатора. Толщина сконструированного суперконденсатора составляла 300-400 мкм, плотность энергии и мощности при напряжении 0,7 В – 7,0 Вт/ч и 5,2 кВт/кг.
- Биокаталитическим способом получен хиральный сорбент для высокоэффективной жидкостной хроматографии для разделения оптических изомеров физиологически активных веществ. Хроматографические испытания колонок, упакованных полученным сорбентом, показали высокую энантиоселективность сорбента и хорошую разрешающую способность колонок в разделении аминокислот, их производных и лекарственных препаратов группы профенов (метилкислоты) и бета‑блокаторов (аминоспирты). По 19 тестируемым рацематам физиологически активных веществ были достигнуты величины селективности от 1.5 до 4.6 при разрешающей способности до 9.54, что в большинстве случаев обеспечивает разделение оптических изомеров до базовой линии.
- Проведена биокаталитическая трансформация флавоноида дигидрокверцитина с участием оксидаз: билирубиноксидазы и высоко редокс-потенциальной грибной лакказы. Продукты ферментативной полимеризации дигидрокверцитина обладали более высокой термостабильностью и антиоксидантной активностью по сравнению с мономером. Анализ спектров ЯМР 1Н и 13С показал принципиальные различия продуктов полимеризации дигидрокверцитина, полученных с участием билирубиноксидазы и лакказы.
- Система лакказа/медиатор была использована для сополимеризации анилина и 2-аминофенитилового спирта на «мягкой» матрице полисульфокрислоты. В результате был получен электропроводящий сополимер с реакционноспособными альдегидными группами, к которым можно «пришивать» различные физиологически активные соединения.
- Проведена ферментативная дериватизация природного флавоноида дигидрокверцетина п-аминобензойной кислотой в бифазной системе этилацетат/цитратный буферный раствор. С помощью протонного и углеродного ЯМР и хромато-масс-спектрометрии, установлена структура продукта, который показал доза-зависимый эффект по отношению к культивируемым клеткам рабдомиосаркомы человека линии RD, что представляет интерес для фармацевтики.
В различные годы сотрудники лаборатории участвовали в исследовательских проектах совместно с другими отечественными лабораториями и международными партнерами. Партнерами Лаборатории являются: НИЦ «Курчатовский институт», ИБФМ РАН, ИФАВ РАН, ИБХФ РАН, Химический факультет МГУ имени М.В. Ломоносова, ИФХЭ РАН, Институт инженерной экологии и химического машиностроения МАМИ, Универстит г. Мальме и Лундский университет (Швеция).
В лаборатории были получены гранты РФФИ и МОН РФ, а также INTAS и Inco-Copernicus.
Сотрудники лаборатории участвуют в различных отечественных и международных мероприятиях в качестве докладчиков и слушателей.
В лаборатории постоянно ведется работа по подготовке молодых специалистов. За время существования лаборатории были защищены 1 докторская и более 10 кандидатских диссертаций.
Сотрудники
СОСТАВ ЛАБОРАТОРИИ
№ | ФИО | Ученая степень, звание | Должность | Место работы | Городской телефон | Внутренний телефон | |
1 | Ярополов Александр Иванович | д.х.н., профессор | зав. лабораторией, г.н.с. | ИНБИ, корп. 2, комн. 217 | (495) 954-44-77 | 157 | yaropolov@inbi.ras.ru |
2 | Васильева Ирина Сергеевна | к.х.н. | н.с. | ИНБИ, корп. 2, комн. 217 | (495) 954-44-77 | 157 | irinasin@yandex.ru |
3 | Кондратьева Елена Геннадьевна | к.ф.-м.н. | н.с. | ИНБИ, корп. 2, комн. 217 | (495) 954-44-77 | 157 | elgenkon@inbox.ru |
4 | Морозова Ольга Владимировна | к.х.н. | с.н.с. | ИНБИ, корп. 2, комн. 217 | (495) 954-44-77 | 157 | morozova@inbi.ras.ru |
5 | Хлупова Мария Евгеньевна | к.б.н. | н.с. | ИНБИ, корп. 2, комн. 217 | (495) 954-44-77 | 157 | dave80@yandex.ru |
РИД
№ | Регистрационный номер | Тип | Название | Авторы | Заявитель/ патентообладатель | Дата приоритета | Дата публикации |
1 | 2446213 | Патент на изобретение РФ | Ферментативный способ получения электропроводящих полимеров | Ярополов А.И., Морозова О.В., Шумакович Г.П., Стрельцов А.В., Горшина Е.С., Бирюков В.В., Русинова Т.В. | ФИЦ Биотехнологии РАН | 24.05.2010 | 27.03.2012 |
2 | 2495509 | Патент на изобретение РФ | Способ получения композитного материала для электрода суперконденсатора | Попов В.О., Липкин А.В., Ярополов А.И., Шумакович Г.П., Морозова О.В., Панкратов Д.В., Васильева И.С., Зейфман Ю.С., Отрохов Г.В. | НИЦ «Курчатовский институт» | 23.07.2012 | 10.10.2013 |
3 | 2564573 | Патент на изобретение РФ | Способ получения ингибитора коррозии меди | Ярополов А.И., Шумакович Г.П., Морозова О.В., Васильева И.С., Хлупова М.Е., Отрохов Г.В., Горшина Е.С., Бирюков В.В., Русинова Т.В. | ФИЦ Биотехнологии РАН | 17.03.2014 | 10.10.2015 |
Публикации
- Khlupova M., Vasil’eva I., Shumakovich G., Zaitseva E., Chertkov V., Shestakova A., Morozova O., Yaropolov A.. Enzymatic Polymerization of Dihydroquercetin (Taxifolin) in Betaine-Based Deep Eutectic Solvent and Product Characterization. Catalysts. 2021. 11(5). Article number: 639
- Vasil’eva I., Shumakovich G., Khlupova M., Vasiliev R., Morozova O., Yaropolov A. Enzymatic synthesis and electrochemical characterization of sodium 1,2-naphthoquinone-4-sulfonate-doped PEDOT/MWCNT composite. RSC Advances. 2020. 10. 33010-33017
- Vasil’eva I.S., Shumakovich G.P., Morozova O.V., Khlupova M.E., Vasiliev R.B., Zaitseva E.A., Yaropolov A.I. Efficiency of a fungal laccase in 3,4-ethylenedioxythiophene polymerization. Chemical Papers. 2018. 72(6) 1499-1505
- Хлупова М.Е., Морозова О.В., Васильева И.С., Шумакович Г.П., Пашинцева Н.В., Ковалев Л.И., Шишкин С.С., Чертков В.А., Шестакова А.К., Кисин А.В., Ярополов А.И. Лакказа-инициированное гетеросочетание дигидрокверцетина и п-аминобензойной кислоты: влияние полученного соединения на культивируемые клетки. Биохимия. 2018. 83(8). 1247-1258
- G.P. Shumakovich, O.V. Morozova, M.E. Khlupova, I.S. Vasil’eva, E.A. Zaitseva, A.I. Yaropolov. Enhanced performance of a flexible supercapacitor due to a combination of pseudocapacitances of both PANI/MWCNT composite electrode and gel polymer redox electrolyte. // RSC Advances. 2017. V. 7. P. 34192-34196. DOI: 10.1039/c7ra04801g
- G.V. Otrokhov, G.P. Shumakovich, M.E. Khlupova, I.S. Vasil’eva, I.B. Kaplan, B.T. Zaitchik, E.A. Zaitseva, O.V. Morozova, A.I. Yaropolov. Biocatalytic approach as alternative to chemical synthesis of polyaniline/carbon nanotube composite with enhanced electrochemical properties. // RSC Advances. 2016. V. 6. P. 60372-60375. DOI: 10.1039/c6ra12352j
- Khlupova M., Vasil’eva I., Shumakovich G., Morozova O., Chertkov V., Shestakova A., Kisin A., Yaropolov A. Laccase-mediated biotransformation of dihydroquercetin (taxifolin). // Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic. 2016. V. 123. № 1. P. 62-66. DOI:10.1016/j.molcatb.2015.11.010
- М.Е. Хлупова, И.С. Васильева, Г.П. Шумакович, О.В. Морозова, В.А. Чертков, А.К. Шестакова, А.В. Кисин, А.И. Ярополов. «Ферментативная полимеризация дигидрокверцетина с участием билирубиноксидазы». // Биохимия. 2015. Т. 80 (2). С. 285-295
- O.D. Hendrickson, O.V. Morozova, A.V. Zherdev, A.I. Yaropolov, S.G. Klochkov, S.O. Bachurin, B.B. Dzantiev. Study of distribution and biological effects of fullerene C60 after single and multiple intragastrical administrations to rats. // Fullerenes, Nanotubes and Carbon Nanostructures. 2015. V. 23(7). P. 658-668. DOI: 10.1080/1536383X.2014.949695
- G.P. Shumakovich, G.V. Otrokhov, M.E. Khlupova, I.S. Vasil’eva, E.A. Zaitseva, O.V. Morozova, A.I. Yaropolov. Laccase-catalyzed synthesis of aniline oligomers and their application for the protection of copper against corrosion. // RSC Advances. 2014. V. 4(57), P. 30193-30196. DOI: 10.1039/c4ra04836a
- Yaropolov A.I., Kharybin A.N., Emneus J., Marko-Varga G., Gorton L. Flow-injection analysis of phenols at graphite electrode modified with co-immobilised laccase and tyrosinase. — Analytica Chimica Acta, 1995, v. 308. p. 137-144 (DOI: 10.1016/0003-2670(94)00404-A)
- Karamyshev A.V., Shleev S.V., Koroleva O.V., Yaropolov A.I., Sakharov I.Yu. Laccase-catalyzed synthesis of conducting polyaniline. — Enzyme and Microbial Technology, 2003, v. 33, № 5, p. 556-564 (DOI: 10.1016/S0141-0229(03)00163-7)
- Shleev S.V., Morozova O.V., Nikitina O.V., Gorshina E.S., Rusinova T.V., Serezhenkov V.A., Burbaev D.S., Gazaryan I.G., Yaropolov A.I. Comparison of physico-chemical characteristics of four laccases from different basidiomycetes. — Biochimie, 2004, v. 86, № 9-10, p. 693-703 (DOI: 10.1016/j.biochi.2004.08.005 )
- S. Shleev, J. Tkac, A. Christenson, T. Ruzgas, A.I. Yaropolov, J.W. Whittaker, L. Gorton. Direct electron transfer between copper-containing proteins and electrodes. — Biosensors & Bioelectronics, 2005, v. 20, № 12, p. 2517-2554 (DOI: 10.1016/j.bios.2004.10.003)
- Shleev S., Jarosz-Wilkolazka A., A. Khalunina, Morozova O., Yaropolov A., Ruzgas T., Gorton L. Direct electron transfer reactions of laccases from different origins on carbon electrodes. — Bioelectrochemistry, 2005, v. 67, № 1, p. 115-124 (DOI: 10.1016/j.bioelechem.2005.02.004)
- Морозова О.В., Шумакович Г.П., Горбачева М.А., Шлеев С.В., Ярополов А.И. «Голубые» лакказы. — Биохимия, 2007, t. 72, № 10, c. 1396-1412 (DOI: 10.1134/S0006297907100112)
- Морозова О.В., Шумакович Г.П., Шлеев С.В., Ярополов А.И. Лакказа-медиаторные системы и их использование. — Прикладная биохимия и микробиология, 2007, t. 43, № 5, c. 583-597 (DOI: 10.1134/S0003683807050055)
- Shleev S., Shumakovich G., Morozova O., Yaropolov A. Stable ‘floating’ air diffusion biocathode based on direct electron transfer reactions between carbon particles and high redox potential laccase. — Fuel Cells, 2010, v. 10, № 4, p. 726-733 (DOI: 10.1002/fuce.200900191)
- Shumakovich G., Kurova V, Vasileva I., Pankratov D., Otrokhov G., Morozova O., Yaropolov A. Laccase-mediated synthesis of conducting polyaniline. — Journal of Molecular Catalysis. B. Enzymology, 2012, v. 77, p. 105-110 (DOI: 10.1016/j.molcatb.2012.01.023)
- Otrokhov G., Pankratov D., Shumakovich G., Khlupova M., Zeifman Y., Vasil’eva I., Morozova O., Yaropolov A. Enzymatic synthesis of polyaniline/multi-walled carbon nanotubecomposite with core shell structure and its electrochemical characterization for supercapacitor application. — Electrochimica Acta, 2014, v. 123. p. 151-157 (DOI: 10.1016/j.electacta.2013.12.089)
Международные проекты
№ |
Фонд/ программа |
Акроним | Наименование проекта на английском языке | Наименование проекта на русском языке | Период проведения работ | Страны-участницы | Сайт проекта |
1 | Контракт №18/05/10 в рамках European Project NMP4-SL-2009-229255 | Three-dimensional nanobiostructure-based self-contained devices for biomedical application | Автономные устройства на основе трехмерных нанобиоструктуд для медицинского применения | 2010 | Швеция, Россия |
Диссертации
№ | Диссертант | Диссертация | Тема работы | Научный руководитель/ консультант |
Год защиты |
1 | Шлеев С.В. | докторская | Функционирование, механизм регуляции активности и возможное практическое использование голубых медьсодержащих оксидаз | Ярополов А.И. | 2010 |
2 | Никитина О.В. | кандидатская | Внеклеточные оксидоредуктазы лигнинолитического комплекса базидиального гриба Trametes Pubescens (Schumach.) Pilát | Шлеев С.В. | 2006 |
3 | Морозова О.В. | кандидатская | Лакказы базидиальных грибов, лакказа-медиаторные системы и возможности их использования | Ярополов А.И. | 2006 |
4 | Горбачева М.А. | кандидатская | Биокаталитические свойства лакказ из различных источников | Шлеев С.В. | 2009 |
5 | Стрельцов А.В. | кандидатская | Биокаталитический синтез электропроводящего полианилина в растворах мицелл додецилбензолсульфоната натрия с участием грибной лакказы Trametes hirsuta и свойства полученного полимера | Ярополов А.И. | 2009 |
6 | Васильева И.С. | кандидатская | Ферментативный синтез различных форм электропроводящего полианилина с участием грибной лакказы Trametes hirsuta и изучение их физико-химических свойств | Ярополов А.И. | 2010 |
7 | Хлупова М.Е. | кандидатская | Электрохимическое определение метаболической активности бактериальных и дрожжевых клеток и разработка микробных биосенсоров | Кузнецов Б.А. | 2012 |
8 | Отрохов Г.В. | кандидатская | Лакказа-медиаторный синтез электропроводящих полимеров и композитных материалов на их основ | Ярополов А.И. | 2015 |